信息科学与工程学院现有“信息与通信工程”一级学科博士点和“电子信息”专博点。“信息与通信工程”一级学科博士学位授权点和硕士点源于1960年我校设立的“无线电设计与制造专业”，1998年获批“通信与信息系统”二级硕士点，2005年获批“信息与通信工程”一级硕士点，2011年获批“信息与通信工程”一级博士点，2019年获“信息与通信工程”博士后流动站。2024年获批“电子信息”专博点。

结合河海大学的特色，学院积极服务于水利、海洋信息化与领域专用通信系统的研究和发展，已成为水利、海洋等行业“信息与通信工程”学科关键技术的创新基地，水利行业信息与通信工程引领者。

“信息与通信工程”一级学科下，设立4个方向：

1.领域无线通信理论与技术

2.智能信息处理及应用

3.电子信息系统与芯片

4.空天地海物联网技术

“电子信息”专博点下，设立4个领域：

1.计算机技术

2.通信工程

3.软件工程

4.人工智能